EO的灭菌原理：
EO可以杀灭各种微生物，包括细菌繁殖体、芽胞、病毒和真菌孢子，是一种广谱灭菌剂。一般认为是由于它能与微生物的蛋白质、DNA和RNA发生非特异性烷基化作用(non specific alkylation)。水溶液中的EO能与蛋白质上的游离羧基(COOH基(2NH2)、硫氢基(2SH)和羟基(2OH)发生烷基化作用，取代不稳定的氢原子而形成带有羟乙根(CH2CH2OH)的化合物，蛋白质上的基团被烷基化，使蛋白质失去了在基本代谢中需要的反应基，阻碍了细菌蛋白质正常的化学反应和新陈代谢，从而导致微生物死亡。
EO杀菌作用是不可逆的，也就是说EO是杀菌剂(sterileagent)而不是消毒剂(disinfectant)。
EO灭菌的优缺点
1、EO灭菌的优点：
能杀灭所 有微生物，包括芽孢 、结核杆菌、细菌、 病毒、真菌等。有标准的化学、生物监测手段，从而可以有效地控制灭菌质量，及时发现灭菌失败的包裹。
灭菌物品可以被包裹、整体封装，可保持使用前呈无菌状态。
相对而言，环氧乙烷不腐蚀塑料、金属和橡胶，不会使物品发生变黄变脆。对不耐热精密仪器灭菌有着非常广泛的用途
能穿透形态不规则、结构复杂、不易通透的物品（如又长又细的导管），进行灭菌。可以用各种包裹材料包裹,便于储存、运输,打开包裹即可使用避免了交叉污染的危险
可用于那些不能用消毒剂浸泡，干热、压力、蒸汽及其他化学气体灭菌之物品的灭菌。
2、EO灭菌的缺点：
整个灭菌循环时间较长，环氧乙烷也具有易燃易爆和有毒性，还有一定的EO残留，需要考虑灭菌后的解析。
纯环氧乙烷应存放在阴凉、通风、无火源、无电开关处。用时轻取轻放，切勿猛裂磕碰。贮存温度应<40℃，以免爆炸。
环氧乙烷也具有易燃易爆和有毒性的特点。厂家在使用环氧乙烷进行灭菌时应符合相关的要求。灭菌工作周边30-50米范围内不得有明火作业，残留的环氧乙烷应进行妥善处理等。
环氧乙烷遇水后可形成有毒的乙二醇，故不可用于食品的灭菌。